Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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