Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms