Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms