Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms