Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms