Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Cdx4Q07424 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms