Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms