Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms