Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms