Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RhodP97348 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RhodP97348 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RhodP97348 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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RhodP97348 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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RhodP97348 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RhodP97348 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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