Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms