Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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