Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lsm6P62313 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms