Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TspoP50637 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms