Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms