Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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