Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtprmP28828 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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