Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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RxraP28700 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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RxraP28700 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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RxraP28700 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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