Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa5P28312 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms