Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18532 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18532 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms