Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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