Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defa-rs1P17533 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defa-rs1P17533 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defa-rs1P17533 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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