Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms