Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms