Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smad6O35182 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms