Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ascl4M0QW46 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms