Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm10378F6XQQ1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms