Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3002E9PW72 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms