Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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