Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms