Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC135083.1-201ENSMUST00000227773 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms