Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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