Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Scn3aA2ASI5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scn3aA2ASI5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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