Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms