Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms