Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lgr5Q9Z1P4 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lgr5Q9Z1P4 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lgr5Q9Z1P4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lgr5Q9Z1P4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lgr5Q9Z1P4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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