Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms