Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Vax2Q9WTP9 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vax2Q9WTP9 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms