Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TnmdQ9EP64 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnmdQ9EP64 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms