Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Borcs8Q9D6Y4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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