Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms