Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms