Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms