Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms