Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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