Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms