Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms