Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hps4Q99KG7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hps4Q99KG7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hps4Q99KG7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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