Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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