Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms